1 、cell counting ：尽量做到准确 ，会影响input结果。
2 、cross link ：甲醛的终浓度是1% ，这个基本所有的protocol上都会强调 。
3 、resuspend cellswith SDS:一定要选用小的tip头 ，在液面下吹打 ，否则很容易产生气泡，后面的sonication就麻烦了 。
4 、sonication ：ChIP中重要的一部分 ，合适的条件要自己摸索 ，可以一次尝试不同次数的sonication，然后建议采用EZ-ChIP上推荐的方法看看sonication的效果如何。
5、加入salmon spermDNA/Protein A or G之前要先混匀 ，因为salmon sperm DNA是很粘稠的物质，若不混匀 ，后面你会发现beads的量不一样，自然也会影响实验的结果。
6 、wash 的时候前面几个步骤可以不用洗的太干净 ，但后一个要尽量吸干净，必要时可用gel loading tips吸 。
7 、含beads的samples离心时 ，有的protocol上推荐是1000rpm ，45秒 ，但可以根据情况调整 ，但要注意转速不能太快防止beads破碎。（当然如果采用的是magnetic的beads就不存在这个问题）
8 、reverse crosslink可以是65°4个小时，也可以overnight。
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